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北卡州立大学,制药公司创建数据库侧重于大的

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罗利 - 研究人员从北卡罗莱纳州立大学和协作制药创造了14000个称为大环内酯自由使用的数据库 - 在药物开发中使用大的分子 - 其中包含有关的分子特征信息,化学多样性和本类结构的生物学活性。数据库,称为MacrolactoneDB,填充关于这些分子知识间隙和可以作为未来药物发现的有用工具。

大环内酯是具有至少12个原子构成的环状结构的分子。在许多有用的特性,大环内酯的能力结合到难的蛋白质靶使它们适用于抗病毒,抗菌,抗真菌和抗寄生虫的药物。但是,那IR的大小和复杂结构使得它们很难合成

“大环内酯是泰坦尼克号的分子 - 它们的大小礼物的挑战,谁可能想与他们合作的研究人员,”肖恩·埃金斯,协作制药的CEO,NC的成员说:国家比较医学研究所,创业者在药房的北卡罗来纳大学教堂山的Eshelman学校住所和研究的通讯作者。 “我们希望通过创建这些分子和他们的财产的公开可用的数据库,以解决这一问题。”

北卡罗莱纳州立研究生和纸张叫Phyo叫Phyo寻开采14000个称为大环内酯13个公共数据库的第一作者,编译他们进入MacrolactoneDB。只有20%的大环内酯化合物,她策划了与T相关的生物数据下摆。

寻,Ekins和化学加文威廉姆斯的北卡罗莱纳州立副教授进行的大环内酯的分子性质的化学信息的分析和开发91点的描述符,以更好地表征分子。然后研究人员看着对于一些大环内酯的三个感兴趣的靶标 - 特异性疟疾,丙型肝炎和T细胞 - 和使用的机器学习技术来理解大环内酯和这些目标之间的结构 - 活性关系

“我们知道,大环内酯药物是有效的,但还有很多我们不知道是什么让一个很好的,”威廉姆斯说。 “这就是为什么我们开始做这个研究。我们发现,可以利用这些分子机器学习,提高我们的分析和说明大环内酯将提高预测模型前进。”

‘有志于这些分子或药物开发利用现在大环内酯有任何一个用户友好的数据库,在那里一切访问,在一个位置,’Ekins说。 “研究人员可以询问什么使得非常适合于特定生物应用程序的特定大环内酯分子的问题。

‘希望MacrolactoneDB将帮助我们理解这个不同类分子,并创造新的前进。’

的工作出现在科学报告和下拨款R44GM122196-02A1和R43AT010585-01S1由美国国立卫生研究院提供了支持。寻获得额外的资金从大学妇女协会和北卡罗莱纳州立研究生研究作为sistantship。

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